Хоча концепцію чистилища часто сприймають як витвір середньовіччя, насправді коріння віри у нього Католицької Церкви сягає як Святого Письма, так і ранньохристиянських вчень.
Одне зі свідчень віри ранньої Церкви у чистилище — це те, як ранні християни поминали померлих у своїй молитвах.
У IV столітті святий Йоан Золотоустий в одному зі своїх листів згадує про молитву за померлих під час Літургії:
«Апостоли не без поважної причини давали настанову поминати спочилих під час відправлення Святих Тайн; бо з нього небіжчик черпає велику користь і допомогу. Чому би молитві за них не умиротворити Бога, коли весь люд, крім священника, стоїть із піднятими руками, а на вівтарі присутня велична Жертва? Щоправда, її складають тільки за тих, хто відійшов із цього світу у вірі».
Святий Григорій Нісський пише дуже схожим чином, згадуючи про цю традицію:
«Апостоли й учні Христа передали нам те, що відтоді набуло сили закону по всій Церкві Божій, а саме, що спомин тих, хто помер в істинній вірі, звершується при відправленні святої і прославленої Тайни».
Святий Августин писав, що його матір, свята Моніка, просила його згадати її біля вівтаря:
«Поклади це тіло куди завгодно, не турбуйся про нього. Лише про те благаю тебе, щоб, де би ти не був, ти згадував мене біля жертовника Господнього».
Навіть Тертуліан у ІІ столітті дав свідчення віри у важливість молитви за померлого під час Меси:
«У роковини смерті ми складаємо Святу Жертву за покійних. Незважаючи на те, що Святе Письмо цього не гарантує, цей звичай походить із традиції; він був підтверджений загальним усиновленням і санкціонований вірою».
Ці цитати — лише невелика частина текстів ранньої Церкви, що демонструють безперервну віру в чистилище.